医疗机构信息系统以严格的权限控制机制，使信息和数据安全可靠，以工作角色确定每个人的工作权限；采用统一的药品管理方式，药品的采购、入库、出库、调价、盘点控制在药库和药房的管理中；处方、医嘱一体化，医生工作站开立处方和医嘱，采用统一的价格体系；医技检查检验结果实现全医疗机构范围内的实时传输与共享，电子病历、健康档案实时为病人、医生、护士、公共卫生提供可视化的信息服务。

自定义报表、自定义图形分析、全成本核算、自定义领导查询系统，根据医疗机构的管理规范和领导查询的需要，实时、准确、动态生成医疗机构管理信息和相关报表为领导和管理者提供决策依据；各种工作量的精确统计为医疗机构定量考核提供准确依据。